Le Nunavut ne possède pas de programme officiel à l'échelle territoriale pour l'élimination des déchets pharmaceutiques résidentiels. Cependant, la plupart des pharmacies et centres communautaires ont des programmes sans caractère officiel de reprise de médicaments périmés ou non utilisés. Grâce à ces collectes, les produits recueillis sont expédiés à l'incinérateur exploité par l'Hôpital Général de Baffin ou le centre régional de récupération pour être catalogués et incinérés.